离心机运转时使用制冷，由于空气的水分，在离心腔内结霜，停机后霜化为水。大部分国外的低速大容量离心机，没有排水孔，离心腔中水愈积愈多。此时，用户应自行拆下转子，清理积水。在重新安装转子时，一定要装好，避免出事故。

     铝合金不能受腐蚀
    离心机转子一般是用铝合金制造，当受腐蚀后强度降低，容易出事故。铝合金易受液体腐蚀，清洗后应用吹风机吹干，或倒置一段时间，确认干了才能使用。有的血站进口离心机，6个铝杯里应有的6个塑料托没有。塑料托中应放血袋，避免直接放在铝杯里。注意试管有无裂纹。若试管(尤其是反复使用的试管)有裂纹，万万不可使用，否则在使用中试管破裂会引起转子旋转中失去平衡，可引发断轴等恶性事故。
    断轴事故
    转子没安放好，或装样品不平衡超过量太大，离心机开动。现代的进口离心机虽都有不平衡保护，即当不平衡量超过某一限时，应自动断电，令离心机停转。但在上述情况下，已经晚了，会出现恶性事故。恶性事故之一是断轴，由于高速旋转中突然断轴，离心转子没有了支撑，在离心腔中乱转乱撞，可使离心机整机转270°角度。此时，若旁边有人员或设备，会造成人员伤亡与毁坏设备的事故。